財團法人國家衛生研究院及國立臺灣大學醫學院附設醫院新竹臺大分院，為建立雙方長期跨領域之轉譯醫學合作研究，推動生技產業發展，自110年起進行合作研究計畫徵求，由雙方計畫主持人針對具學術優勢或產品開發較為成熟的技術提出合作研究計畫構想書。計畫分為「學術研究」及「產業發展」兩類；「產業發展」類計畫須有合作企業之投入。計畫得為「個別型」計畫或「整合型」計畫；「整合型」計畫須至少有3項子計畫。本次公告111年度獲補助計畫：
| 序號 | 計畫名稱 | 合作計畫主持人 | 職稱 | 計畫類別 | 計畫型態 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 大腦膠淋巴系統於腦神經疾病的角色及其相關治療 | 蔡力凱 | 新竹臺大分院神經部主治醫師 | 學術研究類 | 整合型 |
| 謝奉勳 | 國衛院神醫中心副研究員 | ||||
| 吳爵宏 | 新竹臺大分院復健部主治醫師 | ||||
| 2 | 到院前心跳停止危險因子模型暨即時風險預測查詢系統 | 宋之維 | 新竹臺大分院急診醫學部主治醫師 | 學術研究類 | 個別型 |
| 陳麗光 | 國衛院群健所研究員 | ||||
| 3 | 到篩選具潛力的多靶點酪氨酸激酶抑制劑以增進頭頸癌的免疫治療 | 譚慶鼎 | 新竹臺大分院耳鼻喉科主治醫師 | 學術研究類 | 個別型 |
| 陳雅雯 | 國衛院癌研所副研究員 | ||||
| 4 | 低強度經顱聚焦超音波於腦部運動神經調控的開發 | 陳凱翔 | 新竹臺大分院神經部主治醫師 | 學術研究類 | 個別型 |
| 陳景欣 | 國衛院醫奈所研究員 | ||||
| 5 | 巨噬細胞訊息傳遞分子在發炎及自體免疫疾病之角色 | 鄭暉騰 | 新竹臺大分院內科部主治醫師 | 學術研究類 | 個別型 |
| 譚澤華 | 國衛院免疫中心特聘研究員 | ||||
| 6 | 探索非侵入式高頻θ脈衝式經顱磁刺激應用於甲基安非他命使用疾患病人：療效與機轉 | 陳為堅 | 國衛院神醫中心特聘研究員 | 學術研究類 | 個別型 |
| 陳正哲 | 新竹臺大分院精神醫學部主治醫師 | ||||
| 7 | 轉譯基因體學方式解析遺傳性聽損之臨床表現與基因異質性 | 吳振吉 | 新竹臺大分院耳鼻喉部主治醫師 | 產業發展類 | 個別型 |
| 蔡世峯 | 國衛院分基所特聘研究員 |