| 計畫編號 | 計畫名稱 | 執行機構 | 主持人 |
| NHRI-EX96-9201EI | 醫用最低侵入式非線性光學顯微術 | 國立台灣大學 | 孫啟光 |
| NHRI-EX96-9203NI | 探討鈣抑制性腺甘酸環化脢調控神經細胞之機轉 | 中央研究院 | 陳儀莊 |
| NHRI-EX96-9204PP | 醫療衛生中生活品質與成本效性之研究 | 國立台灣大學 | 王榮德 |
| NHRI-EX96-9205PI | 子宮頸前癌與子宮頸癌之分子流行病學研究 | 高雄醫學大學 | 吳明蒼 |
| NHRI-EX96-9206PC | 飲用水消毒以預防細菌性院內感染之前瞻性研究 | 國立高雄師範大學 | 林裕森 |
| NHRI-EX96-9207SI | 哺乳類染色體之結構及功能 | 中國醫藥大學附設醫院 | 林齊強 |
| NHRI-EX96-9208SI | 功能性的探討樹狀突細胞中在登革病毒感染後所活化或抑制的基因 | 國防醫學院 | 賴振宏 |
| NHRI-EX96-9209BC | 人類D型肝炎病毒複製時之專一性 | 中山醫學大學 | 許國堂 |
| NHRI-EX96-9210EC | 中風病患平衡控制恢復機轉及平衡訓練對其跌倒預防之成效 | 國立台灣大學 | 湯佩芳 |
| NHRI-EX96-9302PI | 兒癌病童及父母之適應模式 | 長庚大學 | 葉昭幸 |
| NHRI-EX96-9303SC | 分析LAG-3對調節型T細胞功能的影響 | 長庚紀念醫院 | 黃景泰 |
| NHRI-EX96-9304SC | 基底膜調節類胰島素生長因子訊息傳遞所扮演的角色 | 中山醫學大學 | 李宜儒 |
| NHRI-EX96-9305SC | 應用副甲狀腺素之骨再生研究 | 國立陽明大學 | 陳恆理 |
| NHRI-EX96-9306BI | BRCA1、雌激素接受體及DNA修復蛋白在乳癌所扮演的角色 | 義守大學 | 袁行修 |
| NHRI-EX96-9307BI | 幽門桿菌致癌的訊息傳導機轉探討 | 國立台灣大學 | 陳青周 |
| NHRI-EX96-9308ES | 大腦皮質圓柱結構及功能之高解析擴散平頻譜及功能磁振造影 | 國立台灣大學 | 曾文毅 |
| NHRI-EX96-9309NI | 研究脊髓肌肉萎縮症模式小鼠可能之治療模式 | 中央研究院 | 李鴻 |
| NHRI-EX96-9310PI | 全民健保總額預算後醫院的成本轉嫁與品質表現 | 國立台灣大學 | 鄭守夏 |
| NHRI-EX96-9401NP | 研究類鴉片藥物的作用－從分子到人體（三） | 國防醫學院 | 陶寶綠 |
| NHRI-EX96-9402NI | 前腦紋狀體的神經發育基礎 | 國立陽明大學 | 劉福清 |
| NHRI-EX96-9403NI | 研究CINAP在腦內之功能 | 中央研究院 | 薛一蘋 |
| NHRI-EX96-9404PI | 針對老年髖關節骨折病人之三種照護模式 | 長庚大學 | 徐亞瑛 |
| NHRI-EX96-9405PI | 精神分裂症之NMDA功能缺損：診斷與治療 | 中國醫藥大學附設醫院 | 藍先元 |
| NHRI-EX96-9406PC | 照顧工作對末期癌症病患家屬之影響與居家護理對家屬之效益 | 長庚大學 | 唐秀治 |
| NHRI-EX96-9407PC | 注意力不足過動症的長期追蹤家族研究 | 國立台灣大學 | 高淑芬 |
| NHRI-EX96-9408PC | Alternative Splicing 在演化上的跨物種分析 | 中央研究院 | 莊樹諄 |
| NHRI-EX96-9409SC | 血壓生物回饋之成效及機轉 | 台北醫學大學 | 蔡佩珊 |
| NHRI-EX96-9410BC | TF抗原在癌細胞中表現之功能與機制 | 國立台灣大學 | 黃敏銓 |
| NHRI-EX96-9411BC | tNOX可否作為癌症檢測以及治療的標的物 | 國立中興大學 | 闕斌如 |
| NHRI-EX96-9412EI | 桿狀病毒作為基因載體在組織工程上之應用 | 國立清華大學 | 胡育誠 |
| NHRI-EX96-9413EI | 跑步機訓練對中風病患療效之神經機轉 | 國立陽明大學 | 王瑞瑤 |
| NHRI-EX96-9414NI | 新生鼠抗窒息腦病變之神經保護性前處理的研究 | 國立成功大學 | 黃朝慶 |
| NHRI-EX96-9415SI | 新穎性Aie1蛋白激脢參與生殖細胞分裂之研究 | 中央研究院 | 唐堂 |
| NHRI-EX96-9416BI | 卵巢癌侵犯性相關抑癌基因之研究 | 國立台灣大學 | 林欽塘 |
| NHRI-EX96-9417BI | Epstein-Barr病毒蛋白外鞘之組裝與包裹病毒DNA之機制 | 長庚大學 | 劉世東 |
| NHRI-EX96-9418BI | 肝癌致癌機轉(肝癌專有之新致癌基因)及預防之新思維 | 國立台灣大學 | 張美惠 |
| NHRI-EX96-9419BI | 鼻咽癌分子機轉之探討 | 國立台灣大學 | 蔡錦華 |
| NHRI-EX96-9420BI | 9-amino喜樹鹼葡萄酸?前驅藥物於癌症特異性治療之研究 | 中央研究院 | 羅傅倫 |
| NHRI-EX96-9421BI | 細胞dTTP之調節和基因體穩定性及DNA損壞反應之關係探討 | 國立台灣大學 | 張智芬 |
| NHRI-EX96-9422BI | 以卵巢癌及子宮頸癌為模式研究類胰島素生長因子與癌症的關係 | 國立成功大學 | 周振陽 |
| NHRI-EX96-9423EP | 震波促進骨骼再生之研究 | 長庚紀念醫院 | 王清貞 |
| NHRI-EX96-9424EI | 具生物活性磁振造影對比劑TTDA-Egad應用於活體基因表現之研究 | 高雄醫學大學 | 王雲銘 |
| NHRI-EX96-9425EI | 經皮椎骨整型術之巨觀與微觀生物力學 | 國立台灣大學 | 王兆麟 |
| NHRI-EX96-9426NI | RBM4在肌肉細胞後轉錄調控中所扮演的角色 | 中央研究院 | 譚婉玉 |
| NHRI-EX96-9427NI | 肝癌之過度表現，腫瘤，及轉移基因 | 國立台灣大學 | 許輝吉 |
| NHRI-EX96-9428PI | 食道癌的分子流行病學與分子生物學之研究 | 國立台灣大學 | 李章銘 |
| NHRI-EX96-9429SP | 熱原性外毒素B及其他致病因子在A群鏈球菌感染中扮演的角色 | 國立成功大學 | 林以行 |
| NHRI-EX96-9430SI | 基質軟硬度導致細胞凋亡的分子機制 | 國立成功大學 | 湯銘哲 |
| NHRI-EX96-9431SI | 人類免疫缺乏第一型病毒Gag蛋白表達之調控及其在抗病毒上之應用 | 中央研究院 | 陳士隆 |
| NHRI-EX96-9432SI | 轉糖鏈球菌引發血小板凝集反應的機轉及在實驗心內膜炎的角色 | 國立台灣大學 | 賈景山 |
| NHRI-EX96-9433SI | 日本腦炎病毒調控第一型干擾素之研究 | 中央研究院 | 林宜玲 |
| NHRI-EX96-9434SI | 成人原發性急性骨髓性白血病的分子變異 | 長庚大學 | 施麗雲 |
| NHRI-EX96-9435SI | 糖尿病病人血清因子對克雷白氏菌肝膿瘍致病機制之影響 | 國立台灣大學 | 王錦堂 |
| NHRI-EX96-9501BI | CAP-Rf解螺旋?在C型肝炎病毒致病機制及細胞癌化之角色探討 | 國立陽明大學 | 吳妍華 |
| NHRI-EX96-9502BI | 乳癌鉻胺酸激脢在癌細胞中訊息網路之研究 | 中央研究院 | 陳瑞華 |
| NHRI-EX96-9503BC | MCAF參與EB病毒潛伏與溶裂循環的轉換 | 國立台灣大學 | 張麗冠 |
| NHRI-EX96-9505EI | 高創意奈米粒子微陣排列技術的研發 | 中央研究院 | 陳仲瑄 |
| NHRI-EX96-9506NI | 腦部類鴉片孤兒受體亞型與生理/病理角色之研究 | 國立台灣大學 | 邱麗珠 |
| NHRI-EX96-9507NI | 中樞神經膠質細胞特殊抗原之研究 | 長庚紀念醫院 | 魏國珍 |
| NHRI-EX96-9508NI | 與癌症有關的蛋白-磷蛋白作用機制 | 中央研究院 | 蔡明道 |
| NHRI-EX96-9509NC | 探討Blimp-1標的基因於漿細胞分化的功能 | 中央研究院 | 林國儀 |
| NHRI-EX96-9510NC | 以原蟲為模式研究Myb在細胞分化之功能 | 國立台灣大學 | 孫錦虹 |
| NHRI-EX96-9511PP | 早期精神分裂性障礙症的精神病理演變研究 | 國立台灣大學 | 胡海國 |
| NHRI-EX96-9512PI | 二種中風病人功能評量系統之發展 | 國立台灣大學 | 謝清麟 |
| NHRI-EX96-9513SI | 功能性與結構性探討Rbp1結合蛋白複合體對mRNA代謝的調控 | 國立台灣大學 | 李芳仁 |
| NHRI-EX96-9514SI | 哺乳類紅血球蛋白基因群表現的調控機制 | 中央研究院 | 沈哲鯤 |
| NHRI-EX96-9515SC | 細菌細胞壁生合成醣轉化?PBP1b的結構研究 | 中央研究院 | 馬徹 |
| NHRI-EX96-9516SC | 運用蛋白質貼膚模型和嚴重免疫不全小鼠-人類皮膚模型來研究異位性皮膚炎的致病機轉 | 國立台灣大學 | 王莉芳 |
| NHRI-EX96-9517BI | 研究Eps8蛋白質表達及磷酸化在人類癌症上的意義 | 國立成功大學 | 呂增宏 |
| NHRI-EX96-9518EI | 天然細胞外間質裝載包覆有新型血管新生因子之奈米微粒及其在組織工程上的應用 | 國立清華大學 | 宋信文 |
| NHRI-EX96-9519PI | 早產兒的早期介入 | 國立台灣大學 | 鄭素芳 |
| NHRI-EX96-9520BI | B型肝炎病毒pre-S表面抗原突變型引發肝癌的基因不穩定性 | 國立成功大學 | 黃溫雅 |
| NHRI-EX96-9521BI | D型肝炎病毒複製與肝病變之相關性 | 長庚大學 | 羅時成 |
| NHRI-EX96-9522BI | 砷化物誘引有絲分裂崩猝機制及其於癌症治療之應用 | 中央研究院 | 李德章 |
| NHRI-EX96-9523BI | DNA拓樸異構?在細胞週期檢控點與染色體結構上扮演的角色 | 國立台灣大學 | 李財坤 |
| NHRI-EX96-9524EI | 應用神經工程技術於帕金森症大白鼠的評估與治療研究 | 國立成功大學 | 陳家進 |
| NHRI-EX96-9525EI | 應用計算生物與噬菌體表達技術設計醫療用蛋白質分子 | 中央研究院 | 楊安綏 |
| NHRI-EX96-9526EI | 大腦神經連結與功能之定量化研究：以CRMP-1基因剔除小鼠為模型 | 國立台灣大學 | 陳志宏 |
| NHRI-EX96-9527NI | 探討凋亡分子傳遞活化訊息之分子機制 | 中央研究院 | 賴明宗 |
| NHRI-EX96-9528NI | p53下游基因Rad GTPase的研究 | 國立陽明大學 | 陳芬芳 |
| NHRI-EX96-9529NI | PLZF and PLZF-RAR-alpha於蛋白質sumoylation修飾之功能分析 | 中央研究院 | 施修明 |
| NHRI-EX96-9530NI | 以小鼠模式探討腸病毒七十一型的致病機轉及治療方法 | 國立成功大學 | 陳舜華 |
| NHRI-EX96-9531PI | 少年高血壓危險因子及後續影響 | 中國醫藥大學 | 宋鴻樟 |
| NHRI-EX96-9532SI | TRAIL引發細胞凋亡之調控與在微生物造成免疫性組織傷害之研究 | 國立台灣大學 | 許秉寧 |
| NHRI-EX96-9533SI | 捐贈者T淋巴球在胎兒骨髓幹細胞移植後對誘導受者特異的免疫耐受性之影響 | 長庚紀念醫院 | 陳正昌 |
| NHRI-EX96-9534SI | 日本腦炎病毒與E蛋白間結合的prM蛋白作用區之功能研究 | 國立清華大學 | 吳夙欽 |
| NHRI-EX96-9535SS | 組織工程及三維細胞培養之奈米策略 | 國立中興大學 | 徐善慧 |
| NHRI-EX96-9601BI | 癌症預防–針對表觀遺傳與基因體 | 國立成功大學 | 張玲 |
| NHRI-EX96-9602BC | 口腔癌侵襲轉移機制之研究：探討DNA甲基化之角色 | 國防醫學院 | 謝義興 |
| NHRI-EX96-9603BC | 細胞核內致癌蛋白質ErbB-2對於腫瘤發展形成和癌轉移影響之探討 | 中國醫藥大學附設醫院 | 李龍緣 |
| NHRI-EX96-9604EI | 頸椎患者專一性的有限元素模擬之方法學 | 長庚紀念醫院 | 徐文星 |
| NHRI-EX96-9605NI | 中樞神經系統在肥胖型高血壓所扮演的角色：prolactin-releasing peptide與leptin | 台北醫學大學 | 黃玲玲 |
| NHRI-EX96-9606NI | 鈉離子通道：門閥開關， 離子通透，與藥物作用 | 國立台灣大學 | 郭鐘金 |
| NHRI-EX96-9607PI | 中風及心肌梗塞中間表現型的易感性基因研究 | 高雄醫學大學 | 卓夙航 |
| NHRI-EX96-9608SC | 探討可溶性環氧化合物水解?在粥狀動脈硬化所扮演之角色 | 國立陽明大學 | 李宗玄 |
| NHRI-EX96-9609BI | EB病毒BGLF4 kinase對於上皮細胞生長及移動性之調控 | 國立台灣大學 | 陳美如 |
| NHRI-EX96-9610BI | 放射線引發乙型病毒肝炎發作的旁觀者效應研究 | 國立台灣大學 | 成佳憲 |
| NHRI-EX96-9611BI | NBS1過度表達引起上皮-間葉細胞轉分化及轉移之分子機轉，下游標的基因功能探討與其臨床意義 | 國立陽明大學 | 吳國瑞 |
| NHRI-EX96-9612BI | Disabled-2在抑制腫瘤細胞-血小板交互作用及癌轉位功能的探討 | 長庚大學 | 曾慶平 |
| NHRI-EX96-9613BI | 具有疫苗潛力之腦膜炎雙球菌表面抗原之鑑定與特性分析 | 國立中興大學 | 楊秋英 |
| NHRI-EX96-9614EP | 使用奈米金粒子之多目標光熱治療與光聲影像技術 | 國立台灣大學 | 李百祺 |
| NHRI-EX96-9615EP | 開發促進骨生成之化學藥劑及物理治療 | 高雄醫學大學 | 王國照 |
| NHRI-EX96-9616EI | 以光電技術從事非侵入式口腔癌之早期診斷 | 國立台灣大學 | 楊志忠 |
| NHRI-EX96-9617EI | 省力最佳化輪椅研究 | 國立成功大學 | 蘇芳慶 |
| NHRI-EX96-9618NI | 性別對於感受壓力所誘發情感障礙差異之探討：從分子到行為 | 國立成功大學 | 許桂森 |
| NHRI-EX96-9619NI | 探討突變PINK1引起遺傳性帕金森氏症的致病機轉 | 長庚大學 | 王鴻利 |
| NHRI-EX96-9620NI | 以微陣列基因晶片探索Notch 及Calreticulin的交互作用在神經母細胞瘤可能扮演的角色 | 國立台灣大學 | 許文明 |
| NHRI-EX96-9621PI | 失智長者進食困難之處置 | 國立陽明大學 | 林麗嬋 |
| NHRI-EX96-9622PI | 台灣醫院的競爭與消費者的福利 | 國立台灣大學 | 劉錦添 |
| NHRI-EX96-9623SI | 藉由結構功能性關係探知合成載體的胞內機制 | 台灣科技大學 | 曾文祺 |
| NHRI-EX96-9624SI | 以抗聚乙二醇單鏈Fab膜抗體當報告基因以造影基因於活體內的表現 | 高雄醫學大學 | 鄭添祿 |
| NHRI-EX96-9625SI | 探討Imp4在端粒維持上的分子機制 | 國立陽明大學 | 林敬哲 |
| NHRI-EX96-9626SI | 介白素15系統在T細胞免疫耐受性之角色 | 中央研究院 | 廖南詩 |
| NHRI-EX96-9627SI | 深入探討FHL1蛋白質於心臟肥厚機轉之地位 | 長庚紀念醫院 | 褚柏顯 |
| NHRI-EX96-9628SI | 早期偵測沙門氏菌抗生素抗藥性之研究 | 台北科技大學 | 黃榮堂 |
| NHRI-EX96-9629SI | 探討克拉氏分泌性蛋白質於氣喘的調控角色 | 長庚紀念醫院 | 陳力振 |