| 計畫編號 | 計畫名稱 | 執行機構 | 主持人 |
| NHRI-EX94-9001BL | 研究細胞週期調控之蛋白激之生理功能 | 長庚大學 | 周成功 |
| NHRI-EX94-9002BL | C、D 型肝炎病毒與細胞之交互作用 | 國立陽明大學 | 吳妍華 |
| NHRI-EX94-9003BL | 細胞核仁結構及功能之多變特性研究 | 國立陽明大學 | 葉寧馨 |
| NHRI-EX94-9005NC | 以電生理學方法研究中腦環導水管灰質之類鴉片孤兒受體肽藥理 | 國立台灣大學 | 邱麗珠 |
| NHRI-EX94-9007PC | 癌症的經濟成本及癌症病人的生活品質探討 | 國立陽明大學 | 郎慧珠 |
| NHRI-EX94-9008SC | OPGL/RANK/OPG 的表現及其所引起訊息傳導途徑之研究 | 國防大學 | 徐佳福 |
| NHRI-EX94-9101BC | 有絲分裂檢查點與有絲分裂之進行 | 慈濟大學 | 莊育梩 |
| NHRI-EX94-9102BC | 以精簡雜交和基因微矩陣技術探討肺腺癌致病機轉 | 中山醫學大學 | 蔡菁華 |
| NHRI-EX94-9103EC | 中風後功能預後之追蹤性研究 | 長庚大學 | 吳菁宜 |
| NHRI-EX94-9104EC | 醫用時間解析螢光量測系統之研發 | 義守大學 | 王智昱 |
| NHRI-EX94-9105NN | 鈉離子通道：門閥開關，離子通透，與藥物作用 | 國立台灣大學 | 郭鐘金 |
| NHRI-EX94-9106PN | 嚴重頭部外傷處理準則對病患存活情形及健康相關生活品質之影響 | 台北醫學大學 | 邱文達 |
| NHRI-EX94-9107SC | 分析經由登革病毒 NS1蛋白所引發之自體抗體的病理作用 | 慈濟大學 | 張新侯 |
| NHRI-EX94-9108SC | FHL1 蛋白質於心臟與肌肉之全新地位 | 長庚紀念醫院 | 褚柏顯 |
| NHRI-EX94-9109SC | 確認分離心臟發育的基因 | 國立台灣師範大學 | 蘇銘燦 |
| NHRI-EX94-9110SC | 探討攜帶過敏原及免疫分子 DNA 載體對氣喘老鼠的作用機制 | 長庚大學 | 郭敏玲 |
| NHRI-EX94-9111SC | 以雙標的導向聚陽離子載體進行基因傳遞 | 國立台灣科技大學 | 曾文祺 |
| NHRI-EX94-9112NC | 甲苯損傷腦部發育及行為之機轉 | 慈濟大學 | 陳慧諴 |
| NHRI-EX94-9113PP | 精神分裂症病因因素之研究 | 國立台灣大學 | 胡海國 |
| NHRI-EX94-9114SN | 人類紅血球蛋白基因在個體發展中表現之分子機制 | 中央研究院 | 沈哲鯤 |
| NHRI-EX94-9115SN | 微陣列與生物資訊應用平台技術之建立 | 國立陽明大學 | 吳國海 |
| NHRI-EX94-9201EI | 醫用最低侵入式非線性光學顯微術 | 國立台灣大學 | 孫啟光 |
| NHRI-EX94-9202NI | 恐懼記憶消失機制之探討 | 國立成功大學 | 簡伯武 |
| NHRI-EX94-9203NI | 探討鈣抑制性腺甘酸環化脢調控神經細胞之機轉 | 中央研究院 | 陳儀莊 |
| NHRI-EX94-9204PP | 醫療衛生中生活品質與成本效性之研究 | 國立台灣大學 | 王榮德 |
| NHRI-EX94-9205PI | 子宮頸前癌與子宮頸癌之分子流行病學研究 | 高雄醫學大學 | 吳明蒼 |
| NHRI-EX94-9206PC | 飲用水消毒以預防細菌性院內感染之前瞻性研究 | 國立高雄師範大學 | 林裕森 |
| NHRI-EX94-9207SI | 哺乳類染色體之結構及功能 | 中國醫藥大學附設醫院 | 林齊強 |
| NHRI-EX94-9208SI | 功能性的探討樹狀突細胞中在登革病毒感染後所活化或抑制的基因 | 國防大學 | 賴振宏 |
| NHRI-EX94-9209BC | 人類 D 型肝炎病毒複製時之專一性 | 中山醫學大學 | 許國堂 |
| NHRI-EX94-9210EC | 中風病患平衡控制恢復機轉及平衡訓練對其跌倒預防之成效 | 國立台灣大學 | 湯佩芳 |
| NHRI-EX94-9211SI | 清除接收體的生物功能 : 是友或是敵？ | 國立陽明大學 | 許先業 |
| NHRI-EX94-9212SI | HDAC3 蛋白複合體之功能及其在人類聽障疾病中的角色 | 國立中興大學 | 楊文明 |
| NHRI-EX94-9213SI | 以降眼壓藥增加青光眼小樑切除手術成功率之研究 | 高雄醫學大學 | 吳國揚 |
| NHRI-EX94-9214BI | BRAM1 影響 EB 病毒 LMP1 生物功能機轉之研究 | 長庚大學 | 張玉生 |
| NHRI-EX94-9215NI | 壓力與記憶固化作用之相關性研究 : 從分子到行為 | 國立成功大學 | 許桂森 |
| NHRI-EX94-9216BI | 發展放射療法後鼻咽癌復發機率計算圖表 | 和信治癌中心醫院 | 鄭鴻鈞 |
| NHRI-EX94-9217BI | 由死亡受體聚集以促進癌細胞凋亡之研究 | 中央研究院 | 賴明宗 |
| NHRI-EX94-9218BI | 台灣人口及原住民粒腺體 DNA 的多樣性及與疾病的關連 | 馬偕紀念醫院 | 林媽利 |
| NHRI-EX94-9219EI | 利用功能評估研究如何改善對肢體發展障礙兒童之治療 | 國立成功大學 | 林啟禎 |
| NHRI-EX94-9220EI | 光學同調斷層掃描的發展及醫學診斷應用 | 國立台灣大學 | 楊志忠 |
| NHRI-EX94-9221EI | 新型組織工程小口徑生物人工血管的研發 | 國立清華大學 | 宋信文 |
| NHRI-EX94-9222BI | 探討 RNA 結合蛋白質 (Rbp1p) 對 mRNA 代謝的調控 | 國立台灣大學 | 李芳仁 |
| NHRI-EX94-9223BI | 研究 EPS8 蛋白質表達及磷酸化在人類癌症上的意義 | 國立成功大學 | 呂增宏 |
| NHRI-EX94-9224NC | 轉錄輔因子 Zac1 結構與功能的研究 | 國防大學 | 黃世明 |
| NHRI-EX94-9225PP | 肥胖及代謝症候群 | 中央研究院 | 潘文涵 |
| NHRI-EX94-9226PI | 全民健康保險與小孩的健康 | 國立台灣大學 | 劉錦添 |
| NHRI-EX94-9227PI | 台灣醫院急診室之績效分析 – 組織設計與績效之相關性探討 | 中國醫藥大學 | 林妍如 |
| NHRI-EX94-9228SP | 開拓肝臟移植新紀元 | 長庚大學 | 陳肇隆 |
| NHRI-EX94-9229SI | Haptoglobin 在動脈硬化中所扮演之功能角色 | 國立交通大學 | 毛仁淡 |
| NHRI-EX94-9230SI | 阿米巴式趨化運動之分子機轉與調控 | 國立陽明大學 | 陳美瑜 |
| NHRI-EX94-9231SI | 氦氖雷射對黑色素母細胞及角質細胞之作用 | 國立台灣大學 | 余幸司 |
| NHRI-EX94-9232SI | 溫感性水膠用於內視鏡注射治療術 | 國立成功大學 | 林錫璋 |
| NHRI-EX94-9302PI | 兒癌病童及父母之適應模式 | 長庚大學 | 葉昭幸 |
| NHRI-EX94-9303SC | 分析 LAG-3 對調節型 T 細胞功能的影響 | 長庚紀念醫院 | 黃景泰 |
| NHRI-EX94-9304SC | 基底膜調節類胰島素生長因子訊息傳遞所扮演的角色 | 中山醫學大學 | 李宜儒 |
| NHRI-EX94-9305SC | 應用副甲狀腺素之骨再生研究 | 國立陽明大學 | 陳恆理 |
| NHRI-EX94-9306BI | BRCA1 、雌激素接受體及 DNA 修復蛋白在乳癌所扮演的角色 | 義守大學 | 袁行修 |
| NHRI-EX94-9307BI | 幽門桿菌致癌的訊息傳導機轉探討 | 國立台灣大學 | 陳青周 |
| NHRI-EX94-9308ES | 大腦皮質圓柱結構及功能之高解析擴散平頻譜及功能磁振造影 | 國立台灣大學 | 曾文毅 |
| NHRI-EX94-9309NI | 研究脊髓肌肉萎縮症模式小鼠可能之治療模式 | 中央研究院 | 李鴻 |
| NHRI-EX94-9310PI | 全民健保總額預算後醫院的成本轉嫁與品質表現 | 國立台灣大學 | 鄭守夏 |
| NHRI-EX94-9311BS | 子宮頸上皮細胞癌化過程中細胞膜離子運送變化之機轉研究 | 國立成功大學 | 沈孟儒 |
| NHRI-EX94-9312BI | 雙重趨化激素癌症疫苗之開發與研究 | 中國醫藥大學附設醫院 | 吳孟澤 |
| NHRI-EX94-9313BI | EB 病毒 BGLF4 蛋白質激酶在細胞內之訊息傳導路徑 | 國立台灣大學 | 陳美如 |
| NHRI-EX94-9314BI | 子宮頸癌疫苗之研發 | 國防大學 | 陳小梨 |
| NHRI-EX94-9315BC | Notch1 受體訊號傳遞路徑在癌細胞所扮演角色之探討 | 台北醫學大學 | 葉添順 |
| NHRI-EX94-9316EP | 骨質疏鬆症與骨質壞死症之研究 | 高雄醫學大學 | 王國照 |
| NHRI-EX94-9317EI | 含鈀汞齊合金填充材料之研究發展 III | 國立成功大學 | 陳瑾惠 |
| NHRI-EX94-9318EI | 省力最佳化輪椅研究 | 國立成功大學 | 蘇芳慶 |
| NHRI-EX94-9319EI | 植入式神經介面之無線傳接器系統單晶片製造 | 國立中山大學 | 王朝欽 |
| NHRI-EX94-9320EI | 以動態磁振造影評估股骨頭骨髓壞死之過程：實驗雞 | 台北醫學大學 | 陳榮邦 |
| NHRI-EX94-9321EI | 新開發治療股骨轉子間骨折的雙鏍絲骨釘 | 國立台灣大學 | 林晉 |
| NHRI-EX94-9322EI | 以微粒為基材之組織修補材料的研究 | 國立陽明大學 | 王盈錦 |
| NHRI-EX94-9323NI | 多發性周邊神經病變：神經疼痛之機制及與神經退化之相關性 | 國立台灣大學 | 謝松蒼 |
| NHRI-EX94-9324NC | 探討急性酒精暴露對老鼠巨噬細胞的影響 | 中山醫學大學 | 吳文俊 |
| NHRI-EX94-9325NC | 中樞神經系統在肥胖型高血壓所扮演的角色 | 台北醫學大學 | 黃玲玲 |
| NHRI-EX94-9326PI | 失智症老人躁動行為介入方案 | 國立陽明大學 | 林麗嬋 |
| NHRI-EX94-9327SI | 糖尿病之分子病理及治療研究 : 以自研之遺傳性糖尿病鼠為研究模式 | 中央研究院 | 李英惠 |
| NHRI-EX94-9328SI | 探討在端粒酵素缺失之酵母菌中 Hms1p 轉錄因子對 SGS1 表現之調控 | 國立台灣大學 | 鄧述諄 |
| NHRI-EX94-9329SI | 調控端粒酵素及端粒長度之分子機制 | 國立陽明大學 | 吳國瑞 |
| NHRI-EX94-9330SI | 以線虫為模型探討病毒與宿主相互作用 | 國防大學 | 廖經倫 |
| NHRI-EX94-9331SI | 利用線蟲動物模式搜尋調控 DNA 複製次數的因子 | 國立台灣大學 | 吳益群 |
| NHRI-EX94-9332SI | 突發性耳聾之中樞塑性 – 腦磁圖與功能性磁振造影之研究 | 台北榮民總醫院 | 謝仁俊 |
| NHRI-EX94-9401NP | 研究類鴉片藥物的作用－從分子到人體（三） | 國防大學 | 陶寶綠 |
| NHRI-EX94-9402NI | 前腦紋狀體的神經發育基礎 | 國立陽明大學 | 劉福清 |
| NHRI-EX94-9403NI | 研究 CINAP 在腦內之功能 | 中央研究院 | 薛一蘋 |
| NHRI-EX94-9404PI | 針對老年髖關節骨折病人之三種照護模式 | 長庚大學 | 徐亞瑛 |
| NHRI-EX94-9405PI | 精神分裂症之 NMDA 功能缺損 : 診斷與治療 | 中國醫藥大學附設醫院 | 藍先元 |
| NHRI-EX94-9406PC | 照顧工作對末期癌症病患家屬之影響與居家護理對家屬之效益 | 國立陽明大學 | 唐秀治 |
| NHRI-EX94-9407PC | 注意力不足過動症的長期追蹤家族研究 | 國立台灣大學 | 高淑芬 |
| NHRI-EX94-9408PC | Alternative Splicing 在演化上的跨物種分析 | 中央研究院 | 莊樹諄 |
| NHRI-EX94-9409SC | 血壓生物回饋之成效及機轉 | 台北醫學大學 | 蔡佩珊 |
| NHRI-EX94-9410BC | TF 抗原在癌細胞中表現之功能與機制 | 國立台灣大學 | 黃敏銓 |
| NHRI-EX94-9411BC | tNOX 可否作為癌症檢測以及治療的標的物 | 國立中興大學 | 闕斌如 |
| NHRI-EX94-9412EI | 桿狀病毒作為基因載體在組織工程上之應用 | 國立清華大學 | 胡育誠 |
| NHRI-EX94-9413EI | 跑步機訓練對中風病患療效之神經機轉 | 國立陽明大學 | 王瑞瑤 |
| NHRI-EX94-9414NI | 新生鼠抗窒息腦病變之神經保護性前處理的研究 | 國立成功大學 | 黃朝慶 |
| NHRI-EX94-9415SI | 新穎性 Aie1 蛋白激脢參與生殖細胞分裂之研究 | 中央研究院 | 唐堂 |
| NHRI-EX94-9416BI | 卵巢癌侵犯性相關抑癌基因之研究 | 國立台灣大學 | 林欽塘 |
| NHRI-EX94-9417BI | Epstein-Barr 病毒蛋白外鞘之組裝與包裹病毒 DNA 之機制 | 長庚大學 | 劉世東 |
| NHRI-EX94-9418BI | 肝癌致癌機轉 ( 肝癌專有之新致癌基因 ) 及預防之新思維 | 國立台灣大學 | 張美惠 |
| NHRI-EX94-9419BI | 鼻咽癌分子機轉之探討 | 國立台灣大學 | 蔡錦華 |
| NHRI-EX94-9420BI | 9-amino 喜樹鹼葡萄酸苷前驅藥物於癌症特異性治療之研究 | 中央研究院 | 羅傅倫 |
| NHRI-EX94-9421BI | 細胞 dTTP 之調節和基因體穩定性及 DNA 損壞反應之關係探討 | 國立台灣大學 | 張智芬 |
| NHRI-EX94-9422BI | 以卵巢癌及子宮頸癌為模式研究類胰島素生長因子與癌症的關係 | 國立成功大學 | 周振陽 |
| NHRI-EX94-9423EP | 震波促進骨骼再生之研究 | 長庚紀念醫院高雄分院 | 王清貞 |
| NHRI-EX94-9424EI | 具生物活性磁振造影對比劑 TTDA-Egad 應用於活體基因表現之研究 | 高雄醫學大學 | 王雲銘 |
| NHRI-EX94-9425EI | 經皮椎骨整型術之巨觀與微觀生物力學 | 國立台灣大學 | 王兆麟 |
| NHRI-EX94-9426NI | RBM4 在肌肉細胞後轉錄調控中所扮演的角色 | 中央研究院 | 譚婉玉 |
| NHRI-EX94-9427NI | 肝癌之過度表現，腫瘤，及轉移基因 | 國立台灣大學 | 許輝吉 |
| NHRI-EX94-9428PI | 食道癌的分子流行病學與分子生物學之研究 | 國立台灣大學 | 李章銘 |
| NHRI-EX94-9429SP | 熱原性外毒素 B 及其他致病因子在 A 群鏈球菌感染中扮演的角色 | 國立成功大學 | 林以行 |
| NHRI-EX94-9430SI | 基質軟硬度導致細胞凋亡的分子機制 | 國立成功大學 | 湯銘哲 |
| NHRI-EX94-9431SI | 人類免疫缺乏第一型病毒 Gag 蛋白表達之調控及其在抗病毒上之應用 | 中央研究院 | 陳士隆 |
| NHRI-EX94-9432SI | 轉糖鏈球菌引發血小板凝集反應的機轉及在實驗心內膜炎的角色 | 國立台灣大學 | 賈景山 |
| NHRI-EX94-9433SI | 日本腦炎病毒調控第一型干擾素之研究 | 中央研究院 | 林宜玲 |
| NHRI-EX94-9434SI | 成人原發性急性骨髓性白血病的分子變異 | 長庚大學 | 施麗雲 |
| NHRI-EX94-9435SI | 糖尿病病人血清因子對克雷白氏菌肝膿瘍致病機制之影響 | 國立台灣大學 | 王錦堂 |
| NHRI-EX94-9436SI | 探討 Imp4 在端粒所扮演的角色 | 國立陽明大學 | 林敬哲 |
| NHRI-EX94-9437SI | 介白素 15 受器 alpha 鏈對 T 細胞活化及自體免疫之調控 | 中央研究院 | 廖南詩 |