| 計畫編號 | 計畫名稱 | 執行機構 | 主持人 |
| DOH87-HR-305 | 衛生政策研究群體計畫 | 台灣大學 | 楊志良 |
| DOH87-HR-306 | 多層面精神病理研究群體計畫 | 台灣大學 | 胡海國 |
| DOH87-HR-318 | 衛生政策與經濟研究室計畫 | 陽明大學 | 藍忠孚 |
| DOH87-HR-319 | 原住民健康研究室計畫 | 高雄醫學院 | 葛應欽 |
| DOH87-HR-320 | 近視研究室計畫 | 台灣大學 | 洪伯廷 |
| DOH87-HR-401 | 前瞻性支付制度下的醫院管理模式之建立 | 長庚大學 | 張昭雄 |
| DOH87-HR-402 | 研究類鴉片藥物的作用–從分子到人體 | 國防醫學院 | 陶寶綠 |
| DOH87-HR-403 | 致癌作用與癌症化學預防之生化機制 | 台灣大學 | 林仁混 |
| DOH87-HR-501 | 高雄醫學院磁振造影劑研究室 | 高雄醫學院 | 劉金昌 |
| DOH87-HR-502 | C,D型肝炎病毒複製及對肝癌細胞株作用機制之探討 | 陽明大學 | 吳妍華 |
| DOH87-HR-503 | 無機砷對健康危害之世代追蹤研究 | 台灣大學 | 陳建仁 |
| DOH87-HR-504 | 環境病職業病研究群體計畫 | 台灣大學 | 王榮德 |
| DOH87-HR-505 | 粒線體疾病研究室 | 陽明大學 | 魏耀揮 |
| DOH87-HR-506 | 血管性痴呆症及腦中風後行為神經學異常之研究室 | 高雄醫學院 | 劉景寬 |
| DOH87-HR-507 | 肝癌細胞生長與死亡之調控機制之研究 | 台北榮民總醫院 | 周成功 |
| DOH87-HR-508 | 免疫病之Ｔ細胞調節及實驗性治療 | 陽明大學 | 韓韶華 |
| DOH87-HR-509 | 海洋抗腫瘤藥物的開發研究 | 中山大學 | 沈雅敬 |
| DOH87-HR-510 | 心臟血管調控之頻譜分析研究 | 陽明大學 | 陳慶鏗 |
| DOH87-HR-511 | 以光學及單神經細胞動態模擬方式進行神經細胞調節機制之研究 | 台灣大學 | 郭德盛 |
| DOH87-HR-512 | 新抑癌素的蛋白對生色團反應的影響 | 彰化師範大學 | 金德航 |
| DOH87-HR-513 | 內生性脂質氧化抑制因子之探討 | 成功大學 | 張文昌 |
| DOH87-HR-514 | 應用遺傳工程技術改變綠膿桿菌外毒素A為具醫療用途之蛋白 | 中央研究院 | 黃昭蓮 |
| DOH87-HR-515 | 中藥抗氧化劑及抗冠狀動脈硬化劑之研究 | 台灣大學 | 郭悅雄 |
| DOH87-HR-516 | 臺灣地區常見癌症分子流行病學研究 | 長庚大學 | 謝玲玲 |
| DOH87-HR-517 | 台灣東部原住民嗜酒相關疾病及其防治計畫之研究 | 慈濟醫學院 | 李明亮 |
| DOH87-HR-518 | 兒童肝癌研究室 | 台灣大學 | 張美惠 |
| DOH87-HR-519 | 癲癇群體計畫 | 成功大學 | 蔡景仁 |
| DOH87-HR-522 | 多重肝炎病毒感染之臨床與基礎研究 | 長庚大學 | 廖運範 |
| DOH87-HR-523 | 病毒性Ｂ及Ｄ型肝炎之分子生物學、免疫學及疫苗發展之群體計畫 | 台灣大學 | 陳定信 |
| DOH87-HR-524 | 癌病治療：放射敏感性與宿主免疫機制的研究 | 台北榮民總醫院 | 陳光耀 |
| DOH87-HR-525 | 台大醫學院癌症研究中心–台灣常見癌症之三年群體研究計畫 | 台灣大學 | 謝長堯 |
| DOH87-HR-601 | 馬偕醫院輸血醫學研究室 | 馬偕紀念醫院 | 林媽利 |
| DOH87-HR-602 | 人類紅血球蛋白基因在個體發展中之分子機制 | 中央研究院 | 沈哲鯤 |
| DOH87-HR-603 | 葡萄糖-6-磷酸去氫酉每缺乏症與紅血球老化分子致病機轉之探討 | 中央研究院 | 唐堂 |
| DOH87-HR-604 | 正常老化、認知障礙及阿爾滋海默氏症：長期追蹤研究 | 台北榮民總醫院 | 劉秀枝 |
| DOH87-HR-605 | 疫苗研究發展群體計畫 | 行政院衛生署預防醫學研究所 | 洪其璧 |
| DOH87-HR-606 | 腸胃道傳染病菌的毒性機理 | 長庚大學 | 歐炯雄 |
| DOH87-HR-607 | 傳統中藥開發研究群體計畫 | 行政院衛生署藥物食品檢驗局 | 廖俊亨 |
| DOH87-HR-608 | 以型一生長激素接受器協助子宮頸癌之診斷治療及預後評估 | 國防醫學院 | 陳小梨 |
| DOH87-HR-609 | 先天性腎上腺增生症的分子機構 | 中央研究院 | 鍾邦柱 |
| DOH87-HR-610 | 一氧化氮及氧游離基在缺血、敗血及休克中之角色 | 長庚大學 | 樓迎統 |
| DOH87-HR-611 | 台灣地區肺癌發生之毒理機轉的探討 | 中山醫學院 | 李輝 |
| DOH87-HR-612 | 酒精研究群體計畫 | 國防醫學院 | 王昀 |
| DOH87-HR-613 | 肝臟影像及治療計劃研究室 | 成功大學 | 林錫璋 |
| DOH87-HR-614 | 輪椅驅動之上肢生物力學研究 | 成功大學 | 蘇芳慶 |
| DOH87-HR-615 | 類鑽碳膜披覆在全人工關節之應用 | 成功大學 | 洪敏雄 |
| DOH87-HR-616 | 內皮素在高血壓合併胰島素抗拒症中之角色 | 台北榮民總醫院 | 何橈通 |
| DOH87-HR-617 | 腫瘤生物學研究室：成立一個體內藥物敏感試驗的治癌模式 | 成功大學 | 蘇益仁 |
| DOH87-HR-618 | 平衡訓練對老年人跌倒防治之效果評量 | 台灣大學 | 胡名霞 |
| DOH87-HR-619 | 極低出生體重兒的早期神經動作發展評估以及發展預後研究 | 台灣大學 | 鄭素芳 |
| DOH87-HR-620 | 多氯聯苯中毒與肝炎病毒對肝之共同作用與長期影響 | 成功大學 | 郭育良 |
| DOH87-HR-621 | 青少年藥物濫用之起因：一個社會學習模型 | 中央研究院 | 吳齊殷 |
| DOH87-HR-622 | 重組蛋白質在活體外及活體內之摺疊 | 中興大學 | 林松池 |
| DOH87-HR-623 | 以微囊包埋經基因轉染之細胞株作為人類癌病分子治療的可行性研究 | 長庚大學 | 顏榮郎 |
| DOH87-HR-624 | 光感細胞於老年性黃斑部病變及視網膜變性之細胞死亡機轉 | 國防醫學院 | 張正忠 |
| DOH87-HR-625 | 研究EGF receptor和c-Src 彼此間作用在乳癌引發上的意義 | 成功大學 | 呂增宏 |
| DOH87-HR-626 | 類風濕關節炎的危險因子及長期預後 | 台灣大學 | 陳建煒 |
| DOH87-HR-627 | 宿主易感性和肝細胞癌 | 台灣大學 | 于明暉 |
| DOH87-HR-628 | 調控檸檬酸代謝之基因轉錄於攝護腺 | 長庚大學 | 莊宏亨 |
| DOH87-HR-629 | 人類多瘤性病毒JC病毒之分子特性化 | 中山醫學院 | 張德卿 |
| DOH87-HR-630 | RP-1基因之功能研究：一個”普遍變異型免疫缺陷疾病”潛在性致病基因 | 台灣大學 | 林琬琬 |
| DOH87-HR-631 | RNA 結合蛋白質(RBP1)的結構與功能 | 台灣大學 | 李芳仁 |
| DOH87-HR-632 | 神經肌肉疾病之運動單元動作電位研究 | 成功大學 | 林志勝 |
| DOH87-HR-633 | 台北巿石牌地區頭痛之流行病學研究 | 陽明大學 | 王署君 |
| DOH87-HR-634 | 復健醫療品質保證及成果研究資料庫之建立 | 長庚大學 | 潘璦琬 |
| DOH87-HR-635 | 醫學工程研究群體計畫(II) | 台灣大學 | 林峰輝 |
| DOH87-HR-636 | 番荔枝科乙醯生合成物活性物質之研究 | 高雄醫學院 | 吳永昌 |
| DOH87-HR-637 | 敏感性偵測多發性骨髓瘤中對偶基因特異性的基因重組 | 台灣大學 | 周子賓 |
| DOH87-HR-638 | Ｄ型肝炎病毒的複製：Ｄ型肝炎病毒與寄主細胞蛋白間互動關係的探討 | 長庚大學 | 趙玫 |
| DOH87-HR-639 | 在處置創傷病人時醫療工作負荷的評估 | 高雄榮民總醫院 | 黃睦舜 |
| DOH87-HR-640 | 哺餵母奶和配方奶的新生兒尿液有機酸和氨基酸之比較分析：解析我國新生兒營養狀況 | 馬偕紀念醫院 | 林炫沛 |
| DOH87-HR-701 | 肝癌分子病理研究室計畫 | 台灣大學 | 許輝吉 |
| DOH87-HR-702 | 活體肝臟移植群體計畫 | 長庚大學 | 陳肇隆 |
| DOH87-HR-703 | 病毒潛伏性膜蛋白與鼻咽癌之病變之機轉 | 長庚大學 | 張玉生 |
| DOH87-HR-704 | CD30 於惡性腫瘤之功能性角色 | 台灣大學 | 許世明 |
| DOH87-HR-705 | 氣體性神經調控分子及內毒素對中樞心血管調控之影響 | 國防醫學院 | 曾清俊 |
| DOH87-HR-706 | 住院老人及其照顧者出院需求量表之發展 | 長庚大學 | 徐亞瑛 |
| DOH87-HR-707 | 前瞻性記憶在正常與文盲老人及早期失智症患者之研究 | 成功大學 | 白明奇 |
| DOH87-HR-708 | 鼻咽癌之檢測標記及預後因子之評估 | 台灣大學 | 許翠瑛 |
| DOH87-HR-709 | 最小侵入式手術用手術模擬器 | 中央大學 | 曾清秀 |
| DOH87-HR-710 | EB 病毒感染鼻咽癌細胞之分子機轉 | 台灣大學 | 林欽塘 |
| DOH87-HR-711 | 高密度電腦同步定位研究安裝心房高速節律器所致之慢性心房顫動及其電氣病生理 | 台灣大學 | 林俊立 |
| DOH87-HR-712 | 麻醉系統工程與其臨床應用 | 台灣大學 | 章良渭 |
| DOH87-HR-713 | 醫藥上重要的放線菌染色體之研究 | 陽明大學 | 陳文盛 |
| DOH87-HR-714 | 天然萃取物之體內抗癌活性藥物學研究 | 陽明大學 | 葉小帆 |
| DOH87-HR-715 | 抗癌DNA-交互作用劑之研發 | 中央研究院 | 蘇燦隆 |
| DOH87-HR-716 | 藉由活化標定之前驅藥物產生治療指數之癌症化療法 | 中央研究院 | 羅傅倫 |
| DOH87-HR-717 | 早期性過敏反應以及它在免疫性疾病扮演的角色 | 成功大學 | 黎煥耀 |
| DOH87-HR-718 | 酯酵素與酯類藥物之毒理學 | 成功大學 | 楊憲桂 |
| DOH87-HR-719 | 保存移植器官攜氧體之合成研究 | 台北醫學院 | 施子弼 |
| DOH87-HR-720 | 細胞激素-3 植入的癌症疫苗基因治療 | 清華大學 | 江啟勳 |
| DOH87-HR-721 | 門脈高壓老鼠的藥理研究 | 陽明大學 | 黃怡超 |
| DOH87-HR-722 | 糖尿病腎病之微小血管機能異常及基因表達 | 長庚大學 | 楊智偉 |
| DOH87-HR-723 | 真核細胞內部起始轉譯之作用機轉 | 台灣大學 | 張明富 |
| DOH87-HR-724 | 腎小管形成之細胞及分子機制探討 | 成功大學 | 湯銘哲 |
| DOH87-HR-725 | 台灣地區脊髓小腦萎縮症之遺傳分析 | 長庚大學 | 吳雅慧 |
| DOH87-HR-726 | 老鼠肺部在 X-射線照射後的活體分子反應 | 長庚大學 | 洪志宏 |
| DOH87-HR-727 | 感覺神經退化與再生之研究 | 台灣大學 | 謝松蒼 |
| DOH87-HR-729 | TGF-β引起肝癌細胞株凋亡的機制研究 | 台灣大學 | 陳瑞華 |
| DOH87-HR-730 | DNA 錯誤配對修補之研究及其和胃癌與直腸癌之關聯 | 台灣大學 | 吳忠勳 |
| DOH87-HR-732 | 蛋白質磷酸化酉每在神經系統發生時所扮演的角色 | 陽明大學 | 范明基 |
| DOH87-HR-733 | 動力蛋白對生長錐運動及神經生長之研究 | 陽明大學 | 林奇宏 |
| DOH87-HR-734 | 單純庖疹病毒醣蛋白 C 的結構與功能的研究 | 陽明大學 | 洪善鈴 |
| DOH87-HR-736 | Retinoids 對紋狀體神經細胞分化的調控 | 陽明大學 | 劉福清 |
| DOH87-HR-737 | 口腔癌之致病機轉 | 陽明大學 | 張國威 |
| DOH87-HR-738 | Disintegrins 對新生血管之抑制活性和其拮抗癌細胞轉移之探討 | 台灣大學 | 黃德富 |
| DOH87-HR-739 | 含固醇核三帖類成分中藥之藥物探索 | 台灣大學 | 李水盛 |
| DOH87-HR-740 | Connexin-32 基因突變在 X 性染色體遺傳型夏柯馬利圖司疾病中扮演的角色 | 長庚大學 | 王鴻利 |
| DOH87-HR-741 | 白血球間質素四號對嗜伊紅性白血球激活之探討 | 陽明大學 | 萬曉晴 |